浙江省医学科学院成立于1928年，是我省规模最大的公益类综合性医药卫生科研机构。现设有病毒病研究所、寄生虫病研究所、药物研究所（生殖健康研究所）、卫生学研究所、生物工程研究所、保健食品研究所、医学情报研究所、实验动物中心、安全性评价研究中心、职业病防治研究所、实验动物监测管理这些、分子医学中心（团队）等研究所（中心）和团队。拥有浙江省实验动物与安全性评价重点实验室、浙江省生物工程疫苗研究开发重点实验室、浙江省人用物品安全性评价技术研究重点实验室、浙江省神经精神疾病药物研究重点实验室等4个省级重点实验室，设用WHO人类蠕虫病合作研究中心、WHO人类生殖合作研究中心、国家甲型肝炎减毒活疫苗毒种保存中心、国家药品临床研究基地、国家（浙江）新药安全评价研究重点实验室、浙江省中药新药研究开发中心等。
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