中国科学院深海科学与工程研究所位于中国海南省三亚市鹿回头半岛，是中国科学院2011年启动筹建，由海南省人民政府、三亚市人民政府和中国科学院三方联合共建，直属中国科学院的科研事业单位。2017年8月，中科院依托深海所，筹建中科院深海技术创新研究院。研究所定位：利用地域位置，避开传统领域的竞争，形成专业特色，营造文化优势，进入国际前沿，在我国最为临近深海的省份建立完备的国立深海研发基地，成为国家深海研发试验的共享开放平台，填补我国深海战略上的地域空白。突破大深度海洋研究的禁区，突破海洋科学与工程之间，深海科学、深海工程技术研发与海上作业试验之间长期以来相互割裂的障碍，以深海、科学与工程技术的结合、共享与开发平台为基点，构筑科学研究-工程技术-深海作业融合性体系，强化中科院在我国深海事业中的战略性地位。通过牵头组织重大项目，挖掘和促进我院目前非涉海科研团队在海洋科学和工程方面的研发资源和潜力，形成科学院综合优势，增强我院在国家深海战略中的集团性力量，引领我国深海科学、深海技术、资源开发利用和产业化发展。
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