中心是部属正局级公益一类事业单位，主要职责是：提出加强财务管理和推进财务管理改革的建议；承担部本级部门预算资金及党团工会经费等的会计核算任务；承担部系统国库资金集中支付相关业务工作；承担部属单位内部审计和其他各类专项审计业务工作；承担部属单位的资产管理、政府采购和所办实体产权登记等业务工作；承办我部部属单位内控制度研究、内控体系建设与应用、内控制度评估评价、监督落实和财务会计基础工作检查等业务工作；承办我部农业财务管理信息平台的运行与维护工作；开展农业金融、农业保险以及农业支持保护政策等相关研究工作；开展财会综合服务与业务培训等工作。
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